根据《劳动法》、《劳动合同法》以及各地的地方性法规，企业至少需要保存员工考勤记录 两年以上。这是因为《劳动争议调解仲裁法》规定，劳动争议的仲裁时效为一年，但对于因未及时支付劳动报酬发生的争议，时效为两年。为了在发生劳动争议时能够提供有效的证据，企业至少需要保存两年以上的考勤记录。

此外，虽然有些单位可能会保存更长时间的考勤记录，如3年或10年以上，但这些通常是基于单位内部的规定而非法律规定。因此，在实际操作中，企业应遵循当地法律法规的要求，至少保存员工考勤记录两年以上。

建议企业定期检查和更新考勤记录，确保在需要时能够提供完整、准确的记录。同时，企业应妥善保管考勤记录，防止数据丢失或损坏。